В соответствии с вышеуказанным письмом, суммы налога на добавленную стоимость, предъявленные налогоплательщику при приобретении на территории Российской Федерации товаров, работ или услуг, согласно положениям пункта 2 статьи 171 и пункта 1 статьи 172 НК РФ подлежат вычетам в случае приобретения этих товаров, работ или услуг для осуществления операций, облагаемых НДС, после принятия на учет таких товаров, налогов или услуг и при наличии счетов-фактур, выставленных продавцами.
В соответствии с пунктом 1.1 статьи 172 НК РФ указанные налоговые вычеты могут быть заявлены в налоговых периодах в пределах трех лет после принятия на учет приобретенных налогоплательщиком на территории Российской Федерации товаров, работ или услуг, ввезенных им на территорию Российской Федерации.
При этом необходимо учитывать, что в отношении основных средств, оборудования к установке или нематериальных активов, указанных в пунктах 2 и 4 статьи 171 НК РФ, вычет сумм налога производится после принятия на учет данных основных средств, оборудования к установке или нематериальных активов в полном объеме.
Таким образом, принятие к вычету налога на добавленную стоимость на основании одного счета-фактуры частями в разных налоговых периодах в течение трех лет после принятия на учет товаров, работ или услуг, за исключением основных средств, оборудования к установке или нематериальных активов, нормам Налогового кодекса Российской Федерации не противоречит.